Opóźnianie zwrotu VAT w związku z przeprowadzaniem kontroli krzyżowych u partnerów biznesowych podatnika można uznać za rażące naruszenie prawa. Tak uznał Wojewódzki Sąd Administracyjny we Wrocławiu w wyroku w sprawie o sygn. akt I SAB/Wr 5/14.
Organ podatkowy, badając zasadność zwrotu nadwyżki podatku naliczonego nad należnym, może wydłużyć termin tego zwrotu do czasu zakończenia postępowania. Jest to niezwykle uciążliwe dla podatników.